在木瓜中的乳狀液汁，含有一種被稱為木瓜酵素的蛋白質(zhì)分解酶，它跟胃蛋白酶和胰蛋白酶一樣，能夠分解蛋白質(zhì)，因此能幫助我們消化肉類蛋白質(zhì)。飯后吃木瓜，可以幫助消化，有輔助治療腸胃炎、消化不良的效果。

除了幫助消化的功能外，木瓜酵素還有分解并去除肌膚表面的老化角質(zhì)層的作用，常被應用在化妝品中。木瓜還富含β胡蘿卜素，這是一種天然的抗氧化劑，能有效對抗全身細胞的氧化，破壞使人體加速衰老的氧自由基。因此，常吃木瓜還有美容護膚、延緩衰老的功效。