慢性腹瀉的原發(fā)疾病或病因診斷須從病史、癥狀、體征、實(shí)驗(yàn)室檢查中獲得依據(jù)，可從起病及病程、腹瀉次數(shù)及糞便性質(zhì)、腹瀉與腹痛的關(guān)系、伴隨癥狀和體征、緩解與加重的因素等方面收集臨床資料。這些臨床資料有助于初步區(qū)別腹瀉源于小腸抑或結(jié)腸。實(shí)驗(yàn)檢查包括糞便檢查、小腸吸收功能測定。輔助檢查手段有：X線檢查；內(nèi)窺鏡；超聲波；小腸黏膜活組織檢查。