男生在性行為時感到疼痛，可能由多種因素引起，如包皮過長或包莖、生殖系統(tǒng)炎癥、性經(jīng)驗不足、陰莖損傷、心理因素等。

1. 包皮過長或包莖：包皮過長或包莖可能導(dǎo)致包皮口狹窄，在性行為時陰莖勃起，包皮強行上翻，會引起疼痛。這種情況通常需要進行包皮環(huán)切手術(shù)來解決。

2. 生殖系統(tǒng)炎癥：附睪炎、精囊炎、前列腺炎等炎癥，在性興奮時會引起生殖器官充血，從而導(dǎo)致疼痛。針對炎癥，需要根據(jù)具體的病原體選擇合適的抗生素進行治療，如頭孢呋辛酯、左氧氟沙星、阿奇霉素等。

3. 性經(jīng)驗不足：初次性行為或性經(jīng)驗較少時，因緊張、焦慮等情緒，導(dǎo)致性器官肌肉過度收縮，也可能產(chǎn)生疼痛。這需要通過增加性知識、放松心態(tài)來改善。

4. 陰莖損傷：陰莖受到外力撞擊、過度摩擦等損傷，在性行為時會引發(fā)疼痛。輕微損傷一般休息后可緩解，嚴重損傷則需就醫(yī)治療。

5. 心理因素：工作壓力大、精神緊張、焦慮等心理問題，可能影響性感受，導(dǎo)致疼痛。此時，需要調(diào)整心理狀態(tài)，必要時尋求心理醫(yī)生的幫助。

總之，男生性行為時疼痛的原因較為復(fù)雜。如果疼痛持續(xù)或加重，應(yīng)及時到正規(guī)醫(yī)院就診，查明原因，并采取相應(yīng)的治療措施。同時，在日常生活中要注意保持生殖器官的清潔衛(wèi)生，養(yǎng)成良好的生活習(xí)慣。