1、生殖器皰疹病毒HSV兼并神經(jīng)系統(tǒng)病變，生殖器皰疹病毒也許經(jīng)周圍神經(jīng)沿神經(jīng)軸轉(zhuǎn)入三叉神經(jīng)節(jié)，HSV2則轉(zhuǎn)入骶神經(jīng)節(jié)長時間埋伏于神經(jīng)細胞內(nèi)。如機體遭到創(chuàng)傷、高熱、過敏、例假等因素導致感染和復發(fā)時，會并發(fā)腰髓部神經(jīng)炎、脊髓炎，出現(xiàn)臀部及下肢放射性痛苦、膀胱麻木等癥。

2、生殖器皰疹兼并性傳播疾病，如淋病、非淋菌性尿道炎、梅毒、尖銳濕疣、陰道念珠菌病、滴蟲等混合感染故在診治中應當加以注重。

3、生殖器皰疹兼并其他，兼并播散性皰疹、皰疹性腦膜炎、前列腺炎、直腸炎、盆腔炎、脊髓神經(jīng)根疾病等一系列并發(fā)癥。在艾滋病盛行的區(qū)域，該病還可添加艾滋病病毒感染的危險性。

4、生殖器皰疹兼并宮頸癌、陰莖癌，不孕不育，皰疹病毒與宮頸癌、陰莖癌發(fā)作關系密切，據(jù)研討，宮頸癌病人中HSV-2的抗體陽性率明顯高于正常人群。生殖器皰疹也也許是導致人流后不孕癥以及男性不孕癥的重要因素。