1。不規(guī)范治療，抗生素濫用，病毒復(fù)制變異。皰疹病毒本身就很難殺滅，而傳統(tǒng)治療（如阿昔洛韋等抗病毒和抗干擾素，以及免疫制劑等）只醫(yī)院在早期有一定效果。但不規(guī)范治療加劇了病毒耐藥性，給病毒醫(yī)院在體內(nèi)的依附和復(fù)制提供可趁之機，藥物對病毒的殺滅作用遠比不上病毒復(fù)制，使得病毒不斷復(fù)制變異、種群多樣化和復(fù)雜化。同時抗生素濫用影響機體的免疫機能，制約和影響著疾病的治療過程，使得病情反復(fù)難愈。

2。皰疹病毒特殊附著性，傳統(tǒng)治療很難解除。生殖器皰疹的致病病毒（Ⅱ型單純皰疹病毒）潛伏于神經(jīng)節(jié)內(nèi)，麻痹機體免疫調(diào)節(jié)機能，醫(yī)院在機體各項免疫機能正常時時蟄伏待機，當機體調(diào)節(jié)機能紊亂、免疫功能低下時，病毒迅速心活，危害組織器官，醫(yī)院在治療上藥物很難從神經(jīng)節(jié)內(nèi)清理病毒，治療的同時對自身的損傷也較大。

3。皰疹病毒極具偽裝性，誘導(dǎo)機體防御功能。藥效的發(fā)揮先要使得藥物的有效成分進入血液，再隨血液循環(huán)進入到組織細胞液中。再根據(jù)病毒的特征進行識辨并與其結(jié)合殺滅吞噬。臨床表明病毒變異后可進行偽裝，讓機體無法識別，或釋放假信號避免藥物和免疫系統(tǒng)的殺滅，即使治療也可能是暫時性的一種假象，很容易再次復(fù)發(fā)。

4。生殖器皰疹發(fā)病多有合并癥，臨床治療中易被忽視。生殖器皰疹往往不是單獨發(fā)病，一般都是醫(yī)院在其它炎癥或隱性感染后發(fā)病。而醫(yī)院在實際治療中大多被忽視，這樣給復(fù)發(fā)和病毒轉(zhuǎn)移提供了條件。同時治療藥物的相左，藥物間將相互反應(yīng)，對藥效發(fā)揮將起到負面作用，利于病毒的繁殖，治療更加麻煩，傳統(tǒng)治療也更加局限。

5。傳統(tǒng)治療即殺病毒又傷組織，而且成正比。由于病毒的特殊附著性，偽裝性，復(fù)制和變異等特點，藥物的治療難度大。抗病毒類藥物的副作用也大，醫(yī)院在一定區(qū)間內(nèi)對病毒的殺滅效果和對機體的損傷是成正比的。這是傳統(tǒng)治療不能克服和避免的難題。

6。日常中護理不當導(dǎo)致自身接種感染或再次感染。少數(shù)康復(fù)患者體內(nèi)神經(jīng)細胞節(jié)內(nèi)殘余有病毒變異珠，當生病、勞累等免疫力低下時，潛伏的病毒重新復(fù)活繁殖，沿神經(jīng)軸返回皮膚黏膜引起新的皰疹。也有一部分患者因不注意衛(wèi)生，沒有對沾有病菌的衣褲、日用品及時消毒處理而被再次傳染。