生殖器皰疹的發(fā)作和復(fù)發(fā)可給病人帶來很大的苦楚，可能致使播散性皰疹、皰疹性腦膜炎、脊髓脊神經(jīng)根病、盆腔炎等一系列并發(fā)癥。生殖器皰疹病毒與生殖器惡性腫瘤關(guān)系密切。有人提出致使生殖器皰疹的Ⅱ型皰疹病毒可能是宮頸癌的潛在致癌因子。

從心理上來說，生殖器皰疹的發(fā)作和復(fù)發(fā)會形成病人思想負(fù)擔(dān)過重，而呈現(xiàn)心理妨礙懼怕致癌、懼怕傳染給性伴侶、逃避與性伴侶的性日子、不肯與異性交往、致使性功能妨礙，影響家庭和睦，甚至發(fā)作抑郁癥。

孕媽媽患生殖器皰疹還影響優(yōu)生優(yōu)育，可能會致使子宮內(nèi)感染和新生兒皰疹感染，致使流產(chǎn)、死產(chǎn)、新生兒逝世或發(fā)作嚴(yán)重后遺癥。約半數(shù)以上的新生兒皰疹病人會逝世或留傳中樞神經(jīng)系統(tǒng)的后遺癥。