全身性疾病營養(yǎng)性疾病遺傳性疾病或藥物可以引起種種甲的改變。如甲色澤的改變（變白變暗色素沉著淡藍(lán)色黃色等），甲外形的改變（有橫溝發(fā)育不良甲板過厚或過薄過大或過小變脆或與甲床剝離等）。

這些改變有時(shí)誤為灰指甲，但是這些甲病有一個(gè)共同的特點(diǎn)，即全部指（趾）甲都發(fā)生病變，而且同步進(jìn)行，就是說上述內(nèi)因?qū)椎挠绊懯峭瑫r(shí)發(fā)生的。

而灰指甲是由外因引起，真菌對(duì)甲板的感染是陸續(xù)傳染的，有時(shí)見到的多個(gè)甲發(fā)生癬癥，但卻先后出現(xiàn)，并仍可能有一些指甲完全正常，這在內(nèi)因性甲病中是見不到的；這也是灰指甲的鑒別診斷所應(yīng)該注意的。

皮膚病引起的甲病變。如銀屑病皮炎濕疹扁平苔蘚等也可引起甲板增厚變形有凹點(diǎn)或縱嵴等，這些疾病一般同時(shí)有相應(yīng)的皮膚病癥可協(xié)助灰指甲的鑒別診斷。