1、遺傳因素。陰莖的大小受遺傳基因的控制與影響。

2、肥胖。如果小腹部、恥骨聯(lián)合部、會陰部脂肪豐滿突出，陰莖的發(fā)育往往欠佳，陰莖會相對短小。

3、發(fā)育與營養(yǎng)狀況不良。體格健壯、身材高大的男性，外生殖器發(fā)育好，陰莖可能較為粗大，反之則可能小一些，但陰莖的大小不一定會與身高成正比關(guān)系。

4、其他因素。如內(nèi)分泌紊亂、男性激素水平不足、陰睪或陰囊腫脹產(chǎn)生的陰莖“回縮”等，都可能造成陰莖短小。

目前，臨床醫(yī)學(xué)對小陰莖的治療方法主要是手術(shù)，手術(shù)可以達(dá)到兩個目的，一是延長陰莖，再就是增粗陰莖。術(shù)后一般可使短小陰莖增長2-4厘米。對一些伴有陽痿的小陰莖患者，還可將硅膠條插入兩條陰莖海綿體之間以增大和加粗陰莖，優(yōu)點(diǎn)是手術(shù)方法相對簡單、安全，但部分人可能在術(shù)后有陰莖異物感。

陰莖短小的非手術(shù)療法是脂肪顆粒注射法，對陰莖造成負(fù)壓吸引牽拉，以增加陰莖的動脈供血，使陰莖海綿體組織充盈，靜脈回流受限，從而使陰莖不斷增大。

要求患者的內(nèi)分泌功能正常，尤其是血清睪酮水平也應(yīng)在正常范圍之內(nèi)，是一種物理與心理治療相結(jié)合而又不干擾內(nèi)分泌功能的較理想的非手術(shù)整形方法。