生殖器皰疹主要通過性接觸傳染。單純皰疹病毒2型引起的活動(dòng)性皮損中含有活病毒，具有明顯傳染性，復(fù)發(fā)性生殖器皰疹患者可在兩次發(fā)作之間無癥狀地從陰莖、陰道、子宮頸和直腸排出病毒，因此生殖器皰疹（有癥狀和有皮疹）患者和無癥狀的帶病毒者是主要傳染源。

皰疹病毒經(jīng)黏膜或皮膚微細(xì)破損處進(jìn)入人體，先在侵入局部生長繁殖，后經(jīng)血液和神經(jīng)通路散播。生殖器皰疹病毒傳染性極強(qiáng)，凡與患陰莖生殖器皰疹的男性發(fā)生一次性交的女性，有60%～80%的可能也患病?；颊甙Y狀明顯時(shí)傳染性強(qiáng)，無癥狀時(shí)傳染性小，但仍然可能傳染。少數(shù)也可通過污染的物品傳染。