由于腸息肉一般沒有臨床癥狀，即使有，癥狀也沒有特異性，因此，腸息肉的確診主要依賴特殊的器械檢查。臨床常用的有各種消化道內(nèi)鏡，X線消化道造影，CT掃描等等。

1、電子結(jié)腸鏡：這是對結(jié)腸息肉最主要的檢查方法，事實上大部分結(jié)腸息肉是在結(jié)腸鏡檢查過程中偶然發(fā)現(xiàn)的。結(jié)腸鏡從肛門置入，可以檢查全部結(jié)腸以及終末端的小腸（末端回腸）。在結(jié)腸鏡下，可以清晰的觀察腸道的黏膜面，對隆起的息肉非常敏感，小到幾個毫米的息肉都能夠發(fā)現(xiàn)。隨著消化內(nèi)鏡技術(shù)的不斷進步，醫(yī)生不僅可以發(fā)現(xiàn)結(jié)腸息肉，而且可以發(fā)現(xiàn)息肉，而且能夠?qū)ο⑷獾念愋瓦M行初步判斷。對于結(jié)腸息肉，最重要的是鑒別具有癌變傾向的腺瘤性息肉和不會癌變的非腺瘤性息肉。日本醫(yī)生工藤提出了結(jié)腸息肉分型方法，已經(jīng)廣泛應(yīng)用到臨床。根據(jù)這種分型，在染色內(nèi)鏡、放大內(nèi)鏡等先進技術(shù)的幫助下，醫(yī)生已經(jīng)可以通過內(nèi)鏡比較準確的判斷息肉的類型，從而給以相應(yīng)的治療。在結(jié)腸鏡下，可以通過活檢而確診息肉的病理性質(zhì)。結(jié)腸鏡檢查不僅僅可以診斷息肉，而且是治療息肉的重要手段。

2、膠囊內(nèi)鏡和小腸鏡：小腸息肉非常罕見，常常因為腹痛或便血等癥狀在進行膠囊內(nèi)鏡或者小腸鏡檢查中發(fā)現(xiàn)的。膠囊內(nèi)鏡是受檢者通過口服內(nèi)置攝像與信號傳輸裝置的智能膠囊，在消化道內(nèi)運動并拍攝圖像進行腸道檢查的方法，主要用來診斷小腸疾病。膠囊內(nèi)鏡檢查病人無痛苦，對大部分患者都可以完成全部小腸黏膜的觀察，對于小腸疾病的診斷具有重要價值。小腸鏡與結(jié)腸鏡類似，可以觀察小腸黏膜，并且可以對病變部位進行活檢，確定診斷。

3、X線消化道造影： 是指用硫酸鋇作為造影劑，在X線照射下顯示消化道有無病變的一種檢查方法，主要有消化道鋇餐檢查和鋇灌腸兩種方法。消化道鋇餐檢查時患者口服硫酸鋇，主要用來檢查食管、胃和小腸，鋇灌腸時醫(yī)生把硫酸鋇從肛門灌入，主要用來檢查結(jié)腸。X線檢查僅僅能夠發(fā)現(xiàn)一部分比較大的息肉。但是相對消化內(nèi)鏡檢查，優(yōu)點是安全，并發(fā)癥少，而且病人因檢查帶來的不適比較輕微。

4、其他：隨著臨床診斷技術(shù)的不斷進步，現(xiàn)在還出現(xiàn)了CT仿真結(jié)腸鏡，正電子發(fā)射斷層掃描（PET）等技術(shù)，也可以發(fā)現(xiàn)比較大的腸息肉。并對息肉的性質(zhì)作出不同程度的判斷。