關(guān)于甲型肝炎的發(fā)病機(jī)制研究較少，尚未完全闡明。經(jīng)口感染HAV后，發(fā)病前有短暫病毒血癥階段，然后再定位于肝臟。

既往認(rèn)為HAV對肝細(xì)胞有直接損害作用。近年研究表明：實(shí)驗(yàn)感染HAV的動物肝細(xì)胞及HAV體外細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)均不發(fā)生細(xì)胞病變；患者血清CD+8細(xì)胞亞群增高，致敏淋巴細(xì)胞對HAV感染的肝細(xì)胞顯示細(xì)胞中毒性；肝內(nèi)炎癥反應(yīng)明顯等。

根據(jù)研究結(jié)果，目前認(rèn)為，其發(fā)病機(jī)制傾向于以宿主免疫反應(yīng)為主。發(fā)病早期，可能由于HAV在肝細(xì)胞中大量增殖及CD+8細(xì)胞毒性T細(xì)胞殺傷作用共同造成肝細(xì)胞損害，病后期可能以免疫病理損害為主。