閉經(jīng)病變部位在卵巢，即任何原因使卵巢不分泌性激素或分泌性激素水平極度低落，致使子宮內(nèi)膜不能生長，更無周期性變化及剝脫而導(dǎo)致的閉經(jīng)。包括先天性卵巢發(fā)育不全、卵巢早衰，卵巢不敏感綜合征、卵巢組織破壞、卵巢男性化腫瘤、多囊卵巢綜合征、卵泡膜細胞增生癥。

卵巢組織破壞：由于發(fā)病年齡不同，可表現(xiàn)為原發(fā)性閉經(jīng)或繼發(fā)性閉經(jīng)。凡因手術(shù)切除雙側(cè)卵巢、放射治療、嚴重感染或腫瘤使卵巢組織遭受嚴重損壞者，均可導(dǎo)致閉經(jīng)。實驗室檢查雌激素水平極度低落。促性腺激素排出量增高。

卵巢男性化腫瘤：卵巢男性化腫瘤，如睪丸母細胞瘤、含腎上腺皮質(zhì)瘤、卵巢門細胞瘤等均能產(chǎn)生超量的雄激素（血中宰酮含量大于3.0mol/l），抑制下丘腦–垂體–卵巢軸的功而導(dǎo)致閉經(jīng)，男性化征候明顯。該組病人卵巢增大，多為單側(cè)、實質(zhì)性腫瘤，B超和CT可可確診腫瘤性質(zhì)及部位。

多囊卵巢綜合征（PCOS）：又稱Stein–Leventhal綜合征，是以無排卵、閉經(jīng)或月經(jīng)稀發(fā)，月經(jīng)過少、不孕、多毛、肥胖及卵巢多囊性增大等之綜合癥候群。

卵泡細胞增生癥（hyPerthecosis）：為一種非腫瘤性疾病，其病理特點是在遠離卵泡的間質(zhì)內(nèi)存巢（島）性黃素化卵泡膜細胞增生病灶，并產(chǎn)生過多的雄激素（睪酮、二氫睪酮，雄烯二酮、雌酮均明顯升高）引起繼發(fā)閉經(jīng)、不孕，去女性化和明顯男性化癥候，卵巢正常或增大，F(xiàn)SH LH 正常或降低。與多囊卵巢（PCO）鑒別要點：雄激素、雌酮分泌更高、男性化癥候更嚴重，不存在FCO，對克羅米芬治療無反應(yīng)，確診依靠卵巢組織學(xué)檢查。