1、不孕：約有50%左右內異癥患者伴有不孕，在不明原因不孕患者中，約30-40%患內異癥。

2、痛經：內異癥的臨床特征為漸進性痛經，是常見而突出的特征，多為繼發(fā)性，即自發(fā)生內膜異位開始，患者訴說以往月經來潮時并無疼痛，而從某一個時期開始出現痛經，可發(fā)生在月經前、月經時及月經后。

3、周期性直腸刺激癥狀：進行性加劇的周期性直腸刺激癥狀罕見于其他婦科疾病，是診斷本癥最有價值的癥侯，直腸、肛門、外陰部墜脹、墜痛、里急后重感和大便次數增多。當病變逐漸加重時，癥狀日趨明顯，而經后癥狀消失。

4 、月經不調：內異癥患者常有月經周期縮短、經量增多或經期延長等現象，說明患者有卵巢功能障礙表現。月經不調可作診斷參考，但在鑒別診斷中并無價值。

5、性交痛：當存在于陰道穹窿部異位子宮內膜結節(jié)、直腸凹陷結節(jié)或粘連，或卵巢粘連在盆底時，均可產生性交痛。韌帶后葉病灶纖維化增生及收縮明顯時，可以外源性壓迫輸尿管，使其狹窄阻塞，亦可能出現泌尿系統癥狀，嚴重的可發(fā)生輸尿管積水或腎盂積水。

6、周期性膀胱刺激癥狀：當內異癥病變累及膀胱腹膜反褶或侵犯膀胱肌層時，會同時出現經期尿急、尿頻等癥狀。若病變侵犯膀胱粘膜（膀胱子宮內膜異位癥）則有周期性血尿和疼痛。

7、經期或行經前后的急腹癥：一般為卵巢子宮內膜囊腫，有穿破的特點，多數患者因卵巢囊腫扭轉或宮外孕而急診手術。若不手術而好轉時，盆腔粘連加重，今后還會反復破裂發(fā)生急腹癥。

8、周期性下腹不適：本癥狀的出現率高于痛經，無痛經的內異癥患者常存在于本癥狀 出現于輕癥患者，或某些病變雖較重但由于痛閾的個性差異或其他原因，不產生痛經癥狀而僅有經期腰酸 下腹墜脹不適感。