遺傳和家族因素。遺傳因素和家族因素是主要卵巢囊腫的病因之一，約30%-50%卵巢囊腫患者的直系親屬中有腫瘤患者。

長期的飲食結(jié)構(gòu)，生活習(xí)慣不好、心理壓力過大等因素造成體質(zhì)過度酸化，人體整體的機(jī)能下降，引起腎虛，肝腎同源，腎虛肝亦虛，進(jìn)而引起下焦代謝循環(huán)變慢，造成卵巢疾病和內(nèi)分泌失調(diào)，免疫功能下降，成為卵巢囊腫的病因，從而發(fā)展為卵巢組織異常增生，終致卵巢囊腫，甚至癌變。

環(huán)境因素。工業(yè)發(fā)達(dá)國家及上層社會婦女卵巢癌發(fā)病率高，可能與飲食中高膽固醇有關(guān)。另外，電離輻射及石棉、滑石粉會影響卵母細(xì)胞而增加誘發(fā)卵巢囊腫的機(jī)會，吸煙及維生素A、C、E的缺乏也可能與發(fā)病有關(guān)。

卵巢囊腫還多發(fā)生在未產(chǎn)婦或未生育婦，妊娠對卵巢囊腫似有對抗作用，認(rèn)為每日排卵所致卵巢表層上皮細(xì)胞反復(fù)破損與卵巢囊腫發(fā)生有關(guān)。

另外，卵巢囊腫的病因還有乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌多并發(fā)卵巢囊腫，此三種疾病都對此激素有依賴性，也是造成女士卵巢囊腫的原因。