手術(shù)治療分為三類：保守性手術(shù)（保留生育功能的手術(shù)）、半保守性手術(shù)（保留卵巢功能的手術(shù)）、根治性手術(shù)。

（1）保守性手術(shù)（保留生育功能的手術(shù)） 子宮內(nèi)膜異位癥好發(fā)于生育年齡的婦女，對要求生育的年輕患者，在男方生育功能正常的情況下，尤其患者經(jīng)過藥物治療無效者，可選用保守性手術(shù)，在情況允許的情況下，盡量保留卵巢（或部分卵巢）、輸卵管及子宮，盡量切除肉眼可見的盆腔病灶，分離粘連，恢復(fù)盆腔器官的正常解剖，同時手術(shù)時處理好盆腔創(chuàng)面，防止術(shù)后粘連，以達(dá)到保存生育功能和促進(jìn)受孕的目的。

（2）半保守性手術(shù)（保留卵巢功能的手術(shù)）對于年齡在45歲以下、無生育要求，或者盡管病人年齡較輕，但由于臨床癥狀嚴(yán)重、病變廣泛，無法保留生殖功能，或藥物治療效果不佳者，可行半保守性手術(shù)，切除子宮和盡可能切除盆腔內(nèi)膜異位病灶，保留部分、一側(cè)或雙側(cè)正常的卵巢組織，保存病人的卵巢內(nèi)分泌功能。

（3）根治性外科手術(shù) 患者年齡45歲以上，或者盡管病人年齡較輕，不需保留生殖功能者，由于病變廣泛，臨床癥狀嚴(yán)重，經(jīng)藥物治療無效，或者手術(shù)中無法切除異位病灶以防復(fù)發(fā)及手術(shù)后復(fù)發(fā)的病人，可行全宮及雙側(cè)卵巢切除術(shù)及盆腔子宮內(nèi)膜異位病灶切除術(shù)，以達(dá)根治的目的。雙側(cè)卵巢切除后，由于失去卵巢內(nèi)分泌功能的支持，盆腔殘留的病灶可逐漸萎縮而達(dá)治愈。