1、痛經(jīng)和持續(xù)下腹痛。痛經(jīng)是子宮內(nèi)膜異位癥的典型癥狀，且多隨局部病變加重而逐年加劇，疼痛多位于下腹部及腰骶部，可能放射至陰道、會陰、肛門或大腿，常于月經(jīng)來潮前1—2日開始，經(jīng)期第一日最劇，以后逐漸減輕，至月經(jīng)干凈時消失。疼痛的程度與病灶大小并不一定成正比，病變嚴重者如較大的卵巢子宮內(nèi)膜異位囊腫可能疼痛較輕，而散在的盆腔腹膜上的小結(jié)節(jié)病灶反可導致劇烈痛經(jīng)。少數(shù)晚期患者有長期下腹痛，至經(jīng)期更劇。

2、月經(jīng)失調(diào)。約15%的患者有經(jīng)量增多或經(jīng)期延長，少數(shù)可出現(xiàn)經(jīng)前點滴出血。

3、不孕。正常婦女不孕率約為15%，子宮內(nèi)膜異位癥患者可高達40%。

4、性交痛。一般表現(xiàn)為深部性交痛，多見于直腸子宮凹陷有異位病灶或因病變導致子宮后傾固定的患者，且以月經(jīng)來潮前性交痛更為明顯。

5、其他特殊癥狀。少數(shù)患者可出現(xiàn)周期性（月經(jīng)期）便血，尿急，尿頻，血尿，手術瘢痕上包塊的疼痛，此為內(nèi)膜異位侵犯消化道、泌尿道及手術瘢痕等所引起。