對于發(fā)病時間較長的周期性內(nèi)斜視應(yīng)與下列疾病進行鑒別。

1、間歇性斜視（internaittentstrabismus）周期性內(nèi)斜視雖然也具有間歇性的性質(zhì)，但與一般的間歇性內(nèi)斜視不同，后者無時間上的周期規(guī)律。同時在疲勞、調(diào)節(jié)及融合遭受破壞的情況下，不會像間歇性內(nèi)斜視那樣，可以由隱斜變?yōu)轱@斜。

2、周期性動眼神經(jīng)麻痹（cyclicoculomotorparalysis）主要臨床特征為動眼神經(jīng)的麻痹與痙攣呈周期性交替出現(xiàn)，其周期極短，一般為數(shù)秒至數(shù)分鐘。眼位向外下方偏斜，伴有上瞼下垂，瞳孔散大，痙攣時上瞼上舉或退縮，瞳孔痙攣性縮小，眼位恢復(fù)正位。

3、急性共同性內(nèi)斜視（acutecomitantesotropia）常突然發(fā)病，首先出現(xiàn)復(fù)視，而后發(fā)生內(nèi)斜視，可表現(xiàn)為內(nèi)隱斜、間歇性內(nèi)斜或恒定性內(nèi)斜視，眼球水平運動正常，各方向復(fù)像間距相等，無周期規(guī)律性現(xiàn)象。