遺傳因素：如父母雙方均患有復(fù)發(fā)性口腔潰瘍時(shí)，其子女約有80—90%患病，若雙親之一患此病時(shí)，其子女約有50—60%患病。

精神因素：有的口腔潰瘍患者精神緊張、情緒波動(dòng)、睡眠狀況不佳的情況下發(fā)病，可能與植物神經(jīng)功能失調(diào)有關(guān)。

內(nèi)分泌變化：有些女性口腔潰瘍患者往往在月經(jīng)期發(fā)生，可能與體內(nèi)雌激素量下降有關(guān)。有些女性每逢經(jīng)期或行經(jīng)前后就會(huì)出現(xiàn)口腔潰瘍，用藥治療只能暫時(shí)緩解，下月行經(jīng)時(shí)依然如故地出現(xiàn)口腔潰瘍，疼痛難忍，與此同時(shí)，還常伴有口干、心煩、易怒和大便干結(jié)等令人煩惱的癥狀。臨床研究發(fā)現(xiàn)，月經(jīng)期出現(xiàn)口腔潰瘍主要是由于體內(nèi)黃體酮水平增高而雌激素（孕酮等）的水平降低所致。

其他因素：如缺乏微量元素鋅、鐵、葉酸、維生素B12、營(yíng)養(yǎng)不良等，可降低免疫功能，增加復(fù)發(fā)性口腔潰瘍發(fā)病的可能性。病毒可能是口腔潰瘍的始動(dòng)因子，但目前尚未在患者血清中查出相關(guān)抗體，亦未見(jiàn)從口腔潰瘍病損組織中分離出病毒的報(bào)道。細(xì)菌對(duì)口腔潰瘍的作用已提出了多年，與口腔潰瘍關(guān)系密切的細(xì)菌有血鏈球菌及幽門螺桿菌。體內(nèi)超氧自由基的生成和清除率不平衡、血栓素B2和6酮前列腺素比例失調(diào)及總體水平下降可引發(fā)口腔潰瘍。