1、免疫耐受

通俗點講，就是說身體接觸乙肝病毒，沒有像正常情況一樣做出反應去抵抗病毒。乙肝疫苗，其實就是少量的乙肝病毒，注釋入體內，就是希望能夠通過這點少量的病毒引起機體的反應，去對抗病毒。而抗體就是對抗病毒的物質。免疫耐受的人就是碰了病毒也沒有產生抵抗的物質，所以沒有抗體產生。

2、劑量不足

不同人，對于乙肝病毒的反應是不一樣的，當然需要的乙肝病毒的量也是不同的。一般來說，在打了3針的乙肝疫苗之后，90%的人是會因為觸碰了乙肝病毒而產生抗體。但也有人會因為的劑量不足，使得機體不足以產生抗體。這類人，身體的免疫功能是正常的，只是病毒的劑量需要比一般人高。

3、免疫力低下或者服用免疫抑制劑

有些人的身體免疫力低下（比如說艾滋病患者），或者是在注射乙肝疫苗期間服用過免疫抑制劑，在注射疫苗后，身體不能夠根據病毒產生相應量的抗體，或者說產生的抗體含量很低，檢測的儀器根本不能檢查到，所以顯示了抗體陰性。